فیزیولوژی دستگاه گوارش اسب بسیار پیچیده و منحصر به فرد است. جمعیت میکروبی بخش انتهایی دستگاه گوارش اسب ضمن تخمیر و هضم خوراک، نقش اساسی در تولید برخی ویتامینها، تحریک سیستم ایمنی، محافظت از دستگاه گوارش در برابر پاتوژنها، خنثی سازی سموم و تنظیم بیان ژنها در بافت لوله گوارش اسب دارد. از این رو، توجه به پایداری این اکوسیستم میکروبی حساس، تاثیری حیاتی در سلامت و شادابی اسب داشته و عدم توجه به آن میتواند مشکلات جدی در پی داشته باشد.
